MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.06

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019742	GTC	2	6	99	104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019742	GA	3	6	115	120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019742	AT	3	6	837	842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019742	AAT	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019742	AAG	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019742	AGAA	2	8	924	931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019742	AAAT	2	8	954	961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019742	GGC	2	6	4919	4924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019742	CTT	2	6	4948	4953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019742	GGT	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019742	GAC	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019742	CGCTC	2	10	5084	5093	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_019742	GTA	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019742	TAAGG	2	10	5958	5967	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019742	CT	3	6	5990	5995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019742	TTTA	2	8	6158	6165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019742	CT	3	6	6510	6515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019742	GAT	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019742	CCAG	2	8	6574	6581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019742	T	6	6	6587	6592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019742	TTA	2	6	6689	6694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019742	ACG	2	6	6705	6710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019742	CCTCG	2	10	8712	8721	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_019742	A	6	6	12872	12877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019742	A	6	6	12913	12918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019742	ATC	2	6	13005	13010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019742	TTA	2	6	14144	14149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019742	GGC	2	6	17592	17597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019742	A	6	6	17698	17703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019742	ACAA	2	8	19067	19074	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019742	GTT	2	6	19085	19090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019742	TTAT	2	8	19099	19106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019742	T	7	7	19202	19208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019742	GTTT	2	8	19209	19216	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019742	CTAGAA	2	12	19329	19340	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019742	GCA	2	6	19618	19623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019742	AAGT	2	8	20064	20071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019742	ATG	2	6	20236	20241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019742	ATT	2	6	20242	20247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019742	ACT	2	6	20272	20277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019742	TCA	2	6	20312	20317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019742	TCA	2	6	20323	20328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019742	TAA	3	9	20359	20367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019742	TAG	2	6	20371	20376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019742	TGA	2	6	20385	20390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019742	GA	3	6	20393	20398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019742	CT	3	6	20413	20418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019742	T	8	8	20421	20428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019742	GAA	2	6	20487	20492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019742	A	7	7	20755	20761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019742	TA	3	6	24451	24456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019742	TA	3	6	24512	24517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019742	AGC	2	6	24541	24546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.